A Pró-Reitoria de Pesquisa tem como foco o crescimento, a qualidade e a inovação. As principais ações desenvolvidas são: a institucionalização e o acompanhamento dos projetos de pesquisa desenvolvidos pelos professores-pesquisadores da universidade, bem como os produtos gerados por eles; avanço em programas estratégicos para a iniciação científica, visando à ampliação da cultura de produção, pesquisa e inovação de cunho científico como forma de contribuição para a produção intelectual universitária; incremento à captação de recursos financeiros junto às agências de fomento, para ampliação da estrutura de pesquisa da Unimontes; estabelecimento de convênios, parcerias e acordos de cooperação com empresas do setor privado, público, instituições de pesquisa, de ensino e outras, buscando o desenvolvimento conjunto de projetos de pesquisa e potencialização na captação de recursos financeiros; continuidade de apoio à Coordenadoria de Inovação Tecnológica, Incubadora de Empresas de Base Tecnológica (Inemontes) e ao Núcleo de Propriedade Intelectual – Ágora, com vistas à geração de patentes a fim de reforçar ainda mais nosso papel na promoção da cultura inovadora e empreendedora na região Norte de Minas Gerais, bem como atender as exigências do Marco Legal da Ciência e Tecnologia em respeito à Lei nº13.123/2015, denominada Nova Lei da Biodiversidade.
Outras atividades de destaque são: gestão da revista eletrônica Unimontes Científica (RUC) e do Portal de Periódicos em parceria com a Editora Unimontes, como instrumentos necessários à visibilidade da produção acadêmico-científica multidisciplinar; Apoio, participação e organização anual do Fórum de Ensino, Pesquisa, Extensão e Gestão da Unimontes (FEPEG), para divulgação dos produtos de pesquisa de autoria discente e docente; suporte aos Comitês de Ética em Pesquisa e Bem Estar Animal, Comissão Interna de Biossegurança e ao Núcleo de Bioética, com a finalidade de garantir a normatização e segurança na realização das pesquisas. Divulgação dos editais das principais agências de fomento (FAPEMIG, SEDECTES, CNPq, CAPES, FINEP e BNB/Fundeci, entre outros), por meio de contrato com o Sistema Financiar, com atividades de âmbito internacional. Todas estas ações refletirão diretamente no crescimento e na qualidade da pesquisa com foco na tecnologia e na inovação, no âmbito da graduação e pós-graduação, além de ampliar oportunidades para novas parcerias interinstitucionais.